自从上次失败后，数码兽军团受到了严重的打击，这次他们要重新聚集力量再次发动进攻。这次数码兽可以说是做足了准备并将这次战役称作为终极大决斗，他们要和数码宝贝决一雌雄。在数码兽军团中增加了需要狠角色，他们不仅仅攻击能力强大而且防御也高，这样对于数码宝贝来说确实很难对付。在数码宝贝方面也做了些改动，在宝贝进化方面多了很多的分支，同时分支多了技能也增加了不少。但是数码宝贝可以利用自身的团体力量来打败敌人。终极大决斗就在于此。